Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CACNA2D4Q7Z3S7 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms