Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CALCOCO2Q13137 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CALCOCO2Q13137 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CALCOCO2Q13137 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CALCOCO2Q13137 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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CALCOCO2Q13137 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CALCOCO2Q13137 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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CALCOCO2Q13137 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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CALCOCO2Q13137 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CALCOCO2Q13137 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms