Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AP1S2P56377 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AP1S2P56377 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AP1S2P56377 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms