Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTNNB1P35222 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CTNNB1P35222 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms