Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MBD1Q9UIS9 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MBD1Q9UIS9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms