Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
NICN1Q9BSH3 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms