Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDO1Q16878 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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