Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
NR1D2Q14995 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms