Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

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Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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KCNMA1Q12791 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KCNMA1Q12791 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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KCNMA1Q12791 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KCNMA1Q12791 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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