Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PGM1P36871 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PGM1P36871 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PGM1P36871 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PGM1P36871 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGM1P36871 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PGM1P36871 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PGM1P36871 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms