Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DYSF-202ENST00000394120 6543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SMAD2-203ENST00000402690 12075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPM2-203ENST00000397928 6221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 RAVER1-206ENST00000611074 3586 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 GSE1-203ENST00000405402 4366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 KIAA1614-202ENST00000367588 9654 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
MAP1LC3CQ9BXW4 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms