Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC9A4Q6AI14 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC9A4Q6AI14 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms