Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 TSKU-203ENST00000527881 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RAB37-203ENST00000392612 2528 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 MZF1-AS1-202ENST00000600534 2567 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SLC13A4-201ENST00000354042 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PIGG-205ENST00000503111 2629 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LIMCH1-213ENST00000511496 3439 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GUCY2D-201ENST00000254854 3698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PIWIL1-201ENST00000245255 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KCNC2-201ENST00000298972 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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UBE2V1Q13404 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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UBE2V1Q13404 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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UBE2V1Q13404 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ALDH1L1-205ENST00000452905 2758 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
UBE2V1Q13404 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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