Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 AZIN1-202ENST00000347770 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.841e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PICALM-201ENST00000356360 1958 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.97e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 RABGGTB-208ENST00000471759 2137 ntTSL 27.48□□□□□ -1.211e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PICALM-212ENST00000529760 1153 ntTSL 56.94□□□□□ -1.37e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PICALM-220ENST00000532603 566 ntTSL 46.16□□□□□ -1.427e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 RABGGTB-203ENST00000459697 1177 ntTSL 26.05□□□□□ -1.441e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PICALM-214ENST00000530692 963 ntTSL 55.99□□□□□ -1.457e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PICALM-205ENST00000526548 738 ntTSL 1 (best)5.87□□□□□ -1.477e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PICALM-211ENST00000529016 757 ntTSL 35.7□□□□□ -1.57e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 RABGGTB-213ENST00000496055 3863 ntTSL 25.16□□□□□ -1.581e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.647e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 UBXN6-204ENST00000587324 712 ntTSL 323.12■■□□□ 1.297e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 BZW2-203ENST00000407633 898 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.67e-9■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 NAP1L1-216ENST00000549596 1838 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.635e-7■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.345e-7■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RANBP1-204ENST00000416427 645 ntTSL 530.46■■■□□ 2.478e-38■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RANBP1-206ENST00000421656 333 ntTSL 320■□□□□ 0.798e-38■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RANBP1-212ENST00000467920 529 ntTSL 27.54□□□□□ -1.28e-38■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SSU72-203ENST00000378725 619 ntTSL 222.11■■□□□ 1.135e-7■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SSU72-202ENST00000359060 4176 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.425e-7■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.031e-12■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 EXOSC3-203ENST00000465229 1625 ntTSL 219.55■□□□□ 0.721e-12■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PABPN1-205ENST00000555295 406 ntTSL 315.68■□□□□ 0.12e-17■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 HSPB11-203ENST00000371377 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-17■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.762e-17■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 HSPB11-205ENST00000488884 463 ntTSL 26.41□□□□□ -1.382e-17■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 UBE2E1-207ENST00000475680 1138 ntTSL 525.99■■□□□ 1.753e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 UBE2E1-210ENST00000493707 857 ntTSL 37.25□□□□□ -1.253e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.865e-16■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.255e-16■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.382e-9■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.244e-28■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 KCNK5-201ENST00000359534 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.341e-14■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 LRRD1-202ENST00000422722 3511 ntTSL 212.67□□□□□ -0.384e-28■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 CYP51A1-204ENST00000450723 1729 ntTSL 2 BASIC8.15□□□□□ -1.114e-28■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 CYP51A1-202ENST00000422867 747 ntTSL 35.92□□□□□ -1.464e-28■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RAN-204ENST00000464211 562 ntTSL 511.42□□□□□ -0.581e-26■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.742e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.312e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.122e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 UQCRB-208ENST00000521948 997 ntTSL 28.55□□□□□ -1.043e-11■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.82e-20■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-20■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 GSTK1-201ENST00000358406 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.022e-20■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 GSTK1-205ENST00000443571 850 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.22e-20■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 GSTK1-204ENST00000442394 2219 ntTSL 512.54□□□□□ -0.42e-20■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 GSTK1-206ENST00000473649 2692 ntTSL 29.99□□□□□ -0.812e-20■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 TXN2-203ENST00000411915 570 ntTSL 511.49□□□□□ -0.574e-9■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.226e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.716e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.626e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 OLA1-203ENST00000392560 711 ntTSL 510.55□□□□□ -0.726e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.926e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.433e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RECQL4-201ENST00000301323 781 ntTSL 319.8■□□□□ 0.764e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RECQL4-204ENST00000531875 988 ntTSL 519.6■□□□□ 0.734e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.554e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.434e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 RECQL4-203ENST00000529424 324 ntTSL 213.58□□□□□ -0.244e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PSME3-204ENST00000543428 956 ntTSL 226.02■■□□□ 1.763e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.553e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.533e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.523e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 DONSON-203ENST00000417871 1820 ntTSL 524.41■■□□□ 1.53e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 MRPL21-206ENST00000544567 654 ntTSL 324.03■■□□□ 1.443e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 DONSON-211ENST00000457359 2273 ntTSL 522.5■■□□□ 1.193e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.993e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.553e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.53e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SLC2A1-205ENST00000475162 598 ntTSL 517.37■□□□□ 0.373e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 MRPL21-204ENST00000541265 555 ntTSL 416.87■□□□□ 0.293e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.063e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SAMM50-203ENST00000474323 2368 ntTSL 215.35■□□□□ 0.053e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SAMM50-205ENST00000493621 283 ntTSL 215.2■□□□□ 0.023e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PSME3-213ENST00000592169 826 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.063e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PSME3-217ENST00000622892 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.153e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PSME3-205ENST00000545225 3082 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.513e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SAMM50-206ENST00000494795 3248 ntTSL 211.61□□□□□ -0.553e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PSME3-201ENST00000293362 3144 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.593e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 DONSON-209ENST00000444517 1180 ntTSL 1 (best)5.95□□□□□ -1.463e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 SAMM50-202ENST00000465768 169 ntTSL 35.52□□□□□ -1.533e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 DONSON-206ENST00000439593 528 ntTSL 35.46□□□□□ -1.543e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 DONSON-208ENST00000442660 1566 ntTSL 1 (best)5.27□□□□□ -1.573e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 DONSON-212ENST00000460557 786 ntTSL 25.13□□□□□ -1.593e-13■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 KPNB1-202ENST00000535458 3163 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.865e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.421e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.861e-6■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 MED28-203ENST00000503945 879 ntTSL 1 (best)14.52□□□□□ -0.094e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 CHPT1-209ENST00000552329 580 ntTSL 48.92□□□□□ -0.984e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.054e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 TBL1XR1-215ENST00000474363 6229 ntTSL 1 (best)7.83□□□□□ -1.164e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 VBP1-202ENST00000460509 586 ntTSL 26.85□□□□□ -1.314e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.314e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 TBL1XR1-233ENST00000637659 3105 ntTSL 54.8□□□□□ -1.644e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 TBL1XR1-222ENST00000631253 4186 ntTSL 52.75□□□□□ -1.974e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 TBL1XR1-228ENST00000636864 6888 ntTSL 52.39□□□□□ -2.034e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.054e-8■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PHB2-206ENST00000542294 639 ntTSL 224.91■■□□□ 1.588e-12■□□□□ 9.3
PABPC4Q13310 PHB2-210ENST00000544888 872 ntTSL 323.57■■□□□ 1.368e-12■□□□□ 9.3
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 565 ms