Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF6Q9Y4K3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF6Q9Y4K3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms