Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms