Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC4A5Q9BY07 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms