Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP9Q99956 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms