Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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SIX1Q15475 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SIX1Q15475 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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