Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 VPS11-207ENST00000620429 2739 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.581e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 E2F3-202ENST00000535432 4425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.652e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 AEBP2-203ENST00000398731 722 ntTSL 310.82□□□□□ -0.681e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 BSCL2-218ENST00000525000 154 ntTSL 310.36□□□□□ -0.756e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 MCM5-205ENST00000444778 551 ntTSL 510.23□□□□□ -0.776e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 AEBP2-202ENST00000360995 2533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.771e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RPAP1-202ENST00000561603 3906 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.786e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 OGFOD1-201ENST00000336111 2415 ntTSL 210.06□□□□□ -0.81e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 POLR1B-203ENST00000409894 4457 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.831e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SMC2-201ENST00000286398 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.861e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 AEBP2-207ENST00000541908 975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.891e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 POLR1B-204ENST00000417433 3836 ntTSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.911e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ZC3H15-209ENST00000498757 881 ntTSL 29.35□□□□□ -0.916e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 BSCL2-226ENST00000533982 585 ntTSL 59.31□□□□□ -0.926e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SMC2-205ENST00000493955 1408 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.021e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 VPS11-209ENST00000622309 3352 ntTSL 58.65□□□□□ -1.031e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ORC5-206ENST00000477223 780 ntTSL 28.61□□□□□ -1.036e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 PAPOLA-214ENST00000555508 588 ntTSL 28.38□□□□□ -1.076e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COQ9-216ENST00000569980 1118 ntTSL 28.35□□□□□ -1.072e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CEPT1-206ENST00000478042 2175 ntTSL 58.26□□□□□ -1.096e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 VPS11-201ENST00000524454 626 ntTSL 28.14□□□□□ -1.111e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.126e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RAB27A-205ENST00000564609 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.141e-13■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 DCAF13-202ENST00000518554 5300 ntTSL 27.68□□□□□ -1.182e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RAB27A-212ENST00000569493 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.191e-13■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.226e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ATP5A1-204ENST00000586523 4547 nt6.97□□□□□ -1.294e-26■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SRSF11-214ENST00000484162 4008 ntTSL 1 (best)6.91□□□□□ -1.36e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 GTF3C6-202ENST00000480191 800 ntTSL 36.56□□□□□ -1.366e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ZC3H15-204ENST00000445547 776 ntTSL 26.54□□□□□ -1.366e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COPS3-208ENST00000486032 725 ntTSL 26.54□□□□□ -1.361e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.371e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 MCM5-204ENST00000417343 557 ntTSL 56.43□□□□□ -1.386e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 BSCL2-223ENST00000531524 844 ntTSL 36.14□□□□□ -1.436e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.461e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.471e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.486e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 AEBP2-205ENST00000512223 507 ntTSL 35.81□□□□□ -1.481e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SRSF11-206ENST00000461935 3501 ntTSL 1 (best)5.05□□□□□ -1.66e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 DCAF13-207ENST00000611541 3496 nt4.71□□□□□ -1.652e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CEPT1-203ENST00000467362 5300 ntTSL 24□□□□□ -1.776e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CERS2-212ENST00000559660 242 ntTSL 52.21□□□□□ -2.061e-6■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SNU13-205ENST00000463675 786 ntTSL 318.07■□□□□ 0.483e-7■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.153e-7■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SNU13-208ENST00000488571 556 ntTSL 513.98□□□□□ -0.173e-7■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SNU13-206ENST00000469028 736 ntTSL 513.04□□□□□ -0.323e-7■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SRM-206ENST00000490101 461 ntTSL 221.32■■□□□ 11e-18■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RACK1-205ENST00000502905 643 ntTSL 311.14□□□□□ -0.636e-42■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RACK1-217ENST00000507756 889 ntTSL 510.72□□□□□ -0.696e-42■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RANBP1-214ENST00000488484 699 ntTSL 218.14■□□□□ 0.494e-38■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RANBP1-203ENST00000411892 584 ntTSL 217.64■□□□□ 0.414e-38■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 RANBP1-209ENST00000432879 744 ntTSL 316.85■□□□□ 0.294e-38■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ODC1-204ENST00000446285 665 ntTSL 532.39■■■□□ 2.784e-19■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 ODC1-203ENST00000443218 494 ntTSL 220.19■□□□□ 0.824e-19■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 NDUFA4-203ENST00000470761 502 ntTSL 416.51■□□□□ 0.232e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.341e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.893e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 NOP56-220ENST00000616692 2662 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.353e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 NOP56-216ENST00000492135 1143 ntTSL 1 (best)16.99■□□□□ 0.313e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 NOP56-219ENST00000612233 2980 nt15.05■□□□□ 03e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 NOP56-206ENST00000466447 1094 ntTSL 214.44□□□□□ -0.13e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 NOP56-202ENST00000415272 1628 ntTSL 511.81□□□□□ -0.523e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 NOP56-207ENST00000467196 1320 ntTSL 510.56□□□□□ -0.723e-9■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 CIZ1-217ENST00000476541 513 ntTSL 322.03■■□□□ 1.121e-8■□□□□ 9.5
PABPC4Q13310 SURF4-204ENST00000465565 400 ntTSL 323.59■■□□□ 1.371e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 SURF4-205ENST00000467910 693 ntTSL 515.85■□□□□ 0.131e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.031e-9■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PDHA1-206ENST00000422285 3310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.121e-9■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PDHA1-213ENST00000545074 3391 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.171e-9■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PDHA1-208ENST00000478795 791 ntTSL 213.23□□□□□ -0.291e-9■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PDHA1-204ENST00000379806 3484 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-9■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PDHA1-202ENST00000379804 709 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.871e-9■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.054e-6■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.154e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.144e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.024e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.614e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.24e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 SOCS2-208ENST00000549510 581 ntTSL 27.07□□□□□ -1.284e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 VPS72-202ENST00000368892 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best)23.83■■□□□ 1.417e-8■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 VPS72-201ENST00000354473 1347 ntTSL 322.48■■□□□ 1.197e-8■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 VPS72-205ENST00000491094 4267 ntTSL 512.27□□□□□ -0.457e-8■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 RAB35-206ENST00000544304 2449 ntTSL 223.57■■□□□ 1.366e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.626e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.513e-8■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 GTSF1-208ENST00000552395 671 ntTSL 59.55□□□□□ -0.883e-8■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.253e-8■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 GTSF1-204ENST00000546931 902 ntTSL 57.06□□□□□ -1.283e-8■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 GTSF1-207ENST00000552336 520 ntTSL 36.26□□□□□ -1.413e-8■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 GTSF1-202ENST00000546575 458 ntTSL 25.13□□□□□ -1.593e-8■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.326e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 GARS-208ENST00000485784 761 ntTSL 211.08□□□□□ -0.646e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 GARS-209ENST00000496643 772 ntTSL 26.4□□□□□ -1.386e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 COX6A1-203ENST00000550009 572 ntTSL 219.23■□□□□ 0.671e-21■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.787e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.77e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.791e-7■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.377e-11■□□□□ 9.4
PABPC4Q13310 RABGGTB-201ENST00000319942 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-7■□□□□ 9.4
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