Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MYLK-204ENST00000360304 7738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
RETNLBQ9BQ08 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms