Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 RFFL-201ENST00000315249 7293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ST3GAL1-211ENST00000522652 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KLHL34-201ENST00000379499 3641 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TBC1D26-201ENST00000437605 1868 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MROH2A-208ENST00000610772 5324 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
HRCT1Q6UXD1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms