Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
TOP3AQ13472 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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