Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SPIBQ01892 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SPIBQ01892 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms