Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CLK1P49759 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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