Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TTPAP49638 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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