Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GJB2P29033 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB2P29033 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB2P29033 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB2P29033 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GJB2P29033 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GJB2P29033 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms