Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RHCEP18577 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RHCEP18577 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms