Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX49Q9Y6V7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX49Q9Y6V7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX49Q9Y6V7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms