Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
MAP3K4Q9Y6R4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC36.2■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC36.14■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
MAP3K4Q9Y6R4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
MAP3K4Q9Y6R4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms