Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP18Q9UMW8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP18Q9UMW8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
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