Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD8

KCNH3, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH3Q9ULD8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
KCNH3Q9ULD8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
KCNH3Q9ULD8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KCNH3Q9ULD8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms