Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH22Q9UJ99 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH22Q9UJ99 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDH22Q9UJ99 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms