Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUFIP1Q9UHK0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUFIP1Q9UHK0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NUFIP1Q9UHK0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NUFIP1Q9UHK0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUFIP1Q9UHK0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUFIP1Q9UHK0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms