Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E7

PCDH10, Protocadherin-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH10Q9P2E7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCDH10Q9P2E7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PCDH10Q9P2E7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCDH10Q9P2E7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCDH10Q9P2E7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms