Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.34■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
MBD5Q9P267 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35.29■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
MBD5Q9P267 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.26■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
MBD5Q9P267 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
MBD5Q9P267 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms