Protein–RNA interactions for Protein: Q9P258

RCC2, Protein RCC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCC2Q9P258 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RCC2Q9P258 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RCC2Q9P258 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RCC2Q9P258 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RCC2Q9P258 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RCC2Q9P258 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RCC2Q9P258 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RCC2Q9P258 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
RCC2Q9P258 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RCC2Q9P258 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms