Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FBXO28Q9NVF7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FBXO28Q9NVF7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FBXO28Q9NVF7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms