Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW3

APOBEC3C, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3C, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3CQ9NRW3 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-25■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 AKR1A1-211ENST00000495913 421 ntTSL 311.48□□□□□ -0.572e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPDL-201ENST00000295470 3781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-25■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPDL-204ENST00000507721 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 AKR1A1-210ENST00000487654 552 ntTSL 27.77□□□□□ -1.172e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.623e-14■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27-208ENST00000593262 1872 ntTSL 218.07■□□□□ 0.483e-14■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27-201ENST00000253788 490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.693e-14■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27-202ENST00000586277 460 ntTSL 38.72□□□□□ -1.013e-14■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27-204ENST00000588830 318 ntTSL 28.65□□□□□ -1.023e-14■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27-205ENST00000589037 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.28□□□□□ -1.083e-14■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.553e-14■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 EGFL7-206ENST00000492002 654 ntTSL 525.68■■□□□ 1.73e-6■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNU13-205ENST00000463675 786 ntTSL 316.45■□□□□ 0.225e-9■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNU13-204ENST00000402458 462 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.075e-9■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNU13-203ENST00000401959 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.275e-9■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNU13-201ENST00000215956 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.365e-9■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 SNU13-202ENST00000355257 1503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.65e-9■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.043e-7■■□□□ 12.4
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.227e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-207ENST00000549759 559 ntTSL 313.85□□□□□ -0.197e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-204ENST00000547130 559 ntTSL 213.25□□□□□ -0.297e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-212ENST00000550880 595 ntTSL 212.4□□□□□ -0.427e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-201ENST00000243040 564 ntTSL 1 (best)11.55□□□□□ -0.567e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-216ENST00000552341 1980 ntTSL 211.08□□□□□ -0.647e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-218ENST00000552742 571 ntTSL 310.65□□□□□ -0.77e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-203ENST00000351500 478 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.917e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-214ENST00000551018 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.997e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 PFDN5-211ENST00000550846 392 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.997e-10■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 EPB41-208ENST00000460378 5212 ntTSL 1 (best)10.82□□□□□ -0.687e-8■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 EPB41-204ENST00000356093 5857 ntTSL 5 BASIC9.41□□□□□ -0.97e-8■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 EPB41-206ENST00000373798 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.997e-8■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 EPB41-201ENST00000343067 5956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.277e-8■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.023e-11■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-205ENST00000422447 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.43e-11■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-218ENST00000540430 2305 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.943e-11■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-201ENST00000227157 1887 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.043e-11■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 LDHA-204ENST00000396222 1766 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.153e-11■■□□□ 12.3
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-205ENST00000525419 561 ntTSL 323.78■■□□□ 1.44e-15■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-202ENST00000432321 936 ntTSL 217.31■□□□□ 0.364e-15■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-203ENST00000453471 620 ntTSL 316.8■□□□□ 0.284e-15■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-212ENST00000531228 531 ntTSL 216.39■□□□□ 0.214e-15■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-206ENST00000525628 515 ntTSL 216.19■□□□□ 0.184e-15■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-211ENST00000529645 606 ntTSL 313.92□□□□□ -0.184e-15■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 NDUFS8-215ENST00000532399 3072 ntTSL 213.43□□□□□ -0.264e-15■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5E-202ENST00000395659 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.673e-9■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5E-201ENST00000243997 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.13e-9■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.173e-9■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.295e-23■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.775e-11■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 TAF15-210ENST00000604694 891 ntTSL 518.76■□□□□ 0.595e-11■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.535e-11■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.25e-11■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.221e-8■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PPP5C-213ENST00000527623 1215 ntTSL 222.62■■□□□ 1.215e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PPP5C-211ENST00000525507 1300 ntTSL 221.68■■□□□ 1.065e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.035e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.825e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PPP5C-206ENST00000486994 2209 ntTSL 218.11■□□□□ 0.495e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PPP5C-205ENST00000478046 1886 ntTSL 1 (best)15.59■□□□□ 0.095e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PPP5C-207ENST00000487483 4675 ntTSL 515.23■□□□□ 0.035e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 COX7C-204ENST00000510447 581 ntTSL 311.8□□□□□ -0.521e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 COX7C-201ENST00000247655 666 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 COX7C-207ENST00000515763 347 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC10.76□□□□□ -0.691e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 COX7C-203ENST00000509578 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.56□□□□□ -1.041e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 COX7C-206ENST00000513124 693 ntTSL 55.01□□□□□ -1.611e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 COX7C-205ENST00000511472 369 ntTSL 22.84□□□□□ -1.951e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 COX7C-202ENST00000505430 496 ntTSL 32.67□□□□□ -1.981e-7■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.132e-8■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX1-202ENST00000319248 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.182e-8■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 PRDX1-203ENST00000372079 609 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.332e-8■■□□□ 12.2
APOBEC3CQ9NRW3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.652e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.142e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPL18A-202ENST00000597648 683 ntTSL 315.33■□□□□ 0.042e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.052e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NANS-204ENST00000461452 3027 ntTSL 210.89□□□□□ -0.672e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 COPE-210ENST00000600528 261 ntTSL 310.44□□□□□ -0.746e-13■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.061e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.021e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-201ENST00000356769 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.571e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-215ENST00000550920 752 ntTSL 511.07□□□□□ -0.641e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-204ENST00000546392 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.751e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-208ENST00000547914 543 ntTSL 58.61□□□□□ -1.031e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-216ENST00000550952 2922 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.231e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.261e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.791e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 NACA-210ENST00000548386 644 ntTSL 23.26□□□□□ -1.891e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5I-202ENST00000505852 300 ntTSL 211□□□□□ -0.653e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 ATP5I-201ENST00000304312 365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.763e-12■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.883e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.133e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.789e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 UBE2I-218ENST00000568288 501 ntTSL 518.75■□□□□ 0.593e-6■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.369e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 C21orf58-208ENST00000472607 713 ntTSL 316.1■□□□□ 0.179e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 C21orf58-206ENST00000417060 1072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.149e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 C21orf58-210ENST00000491666 1196 ntTSL 515.94■□□□□ 0.149e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.139e-9■■□□□ 12.1
APOBEC3CQ9NRW3 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -03e-6■■□□□ 12.1
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