Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC3

CCNB1IP1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB1IP1Q9NPC3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCNB1IP1Q9NPC3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCNB1IP1Q9NPC3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCNB1IP1Q9NPC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms