Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VCXQ9H320 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VCXQ9H320 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms