Protein–RNA interactions for Protein: Q9C029

TRIM7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM7Q9C029 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM7Q9C029 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM7Q9C029 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms