Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
YIPF4Q9BSR8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
YIPF4Q9BSR8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms