Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF559Q9BR84 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF559Q9BR84 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms