Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TUBA1CQ9BQE3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TUBA1CQ9BQE3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TUBA1CQ9BQE3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms