Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TCF12Q99081 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCF12Q99081 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCF12Q99081 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms