Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CRAMP1Q96RY5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CRAMP1Q96RY5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRAMP1Q96RY5 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRAMP1Q96RY5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRAMP1Q96RY5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRAMP1Q96RY5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRAMP1Q96RY5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRAMP1Q96RY5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRAMP1Q96RY5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRAMP1Q96RY5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRAMP1Q96RY5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms