Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB8

MPP4, MAGUK p55 subfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP4Q96JB8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MPP4Q96JB8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MPP4Q96JB8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms