Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LIN37Q96GY3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LIN37Q96GY3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms