Protein–RNA interactions for Protein: Q96DN0

ERP27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERP27Q96DN0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ERP27Q96DN0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ERP27Q96DN0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ERP27Q96DN0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms